Te aconsejo que los juegos arcade del mame y los de neogeo los metas todos en la carpeta arcade, ya que desde ahi te salen como opciones de carga todos los emuladores del mame y neo geo que tengas, a mi la mayoria de neogeo me los carga con el mame2010 , y los de mame con el mame 2003.. ya es cuestion de que vayas probando, y asi puedes configurar la pantalla a tu gusto, porque es la unica forma que a mi me ha servido.
Ahh, por cierto, que no se te olvide meter el archivo neogeo.zip dentro de la carpeta arcade, que si no, no te funcionaran los de neogeo, y el emulador ir-mame2010 te lo tienes que descargar desde la raspberry ya que no viene por defecto instalada de inicio, si tienes alguna duda mandame privado y te explico mejor, que no es que sea un libro abierto explicandome a veces..

Saludos.