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pues eso, como conecto un dispositivo usb ( un joystick en este caso ) a los puertos gpio? si es que se puede, gracias! a ver si llega la respuesta antes de que rompa algo

Más que preguntar cómo hacerlo, habría que preguntar antes si es psible
Hasta donde yo sé, el GPIO de la placa no está unido al "chipset" USB, por tanto no puedes conectarlo de forma nativa.
Sería necesario usar una emulación USB por software, con los pines de tu elección, pero no creo que sea sencillo en absoluto.

gracias egrueda, imagino que debe ser algo complicado que supera mis conocimientos... si es que se puede. Creo que voy aparcar esa curiosidad y a trastear otras cosas.