Quisiera dejar claro que el autor de estos tutoriales es insertmorecoins y están alojados en su blog, yo sólo me limito a informaros de su existencia porque pienso que es información valiosa para esta comunidad.
De primera os aconsejo leer ¿Qué es una ROM? donde se explica entre otras cosas los distintos tipos de roms que existen (Parent roms y Clone roms) y las tres maneras de organizarlas:
Non-Merged Sets, Merged Sets y Split Sets.

Uso del ClrMamePro:
Tutorial ClrMamePro Volumen (I)
Tutorial ClrMamePro Volumen (II)
Tutorial ClrMamePro Volumen (III)
Y como extra ya que nos estamos curtiendo en el asunto..
¿Qué es un emulador?
Saludos!